自西(🕕)元(yuán )(🍅)20XX年，人类(lèi )从肯亚图尔卡纳(nà )湖的湖畔挖出(chū )了(le )(🔱)一个名叫索哈尔(Zohar)的(🔬)物(🏴)体之后，便(biàn )开始对它进(⏬)行(háng )研(🎏)究(❣)，后来(lái )有人重建出来所(suǒ )谓的“神之(🗄)语(yǔ )言”，并建立电(diàn )脑程式以启动原始索(🛺)哈尔，进行和上(shàng )(🍮)位领(lǐng )域的U-DO(上(shàng )位(wèi )领域当(dāng )中的(⏺)红(hóng )色波动存在)连结的(de )连结实验(yàn )，但很(hěn )不幸地，从(㊗)上(🥎)位领(💻)域(yù )(🗞)流(🙂)入下位领(🐑)域的(🙌)能量造成了事象变移，使地(dì )球(游戏中所(👃)谓的“失落耶路(😍)撒冷(👺)”)几乎完从从(🐀)宇宙中“消失”，人类(🤘)因而被(bèi )(💝)迫逃(táo )亡，离开(👊)地球(qiú )。　　到了四千年多后，在故事开始前十(🌼)五的(💹)T.C.4753年(🎥)，米(mǐ )尔奇(qí )亚行星(xīng )(Miltia)爆(👵)发(♌)了所谓的米尔奇亚冲突(🔎)事件，在此次事件当中，米(mǐ )尔奇亚(🏓)行星的(de )人类(lèi )疑似遭到(dào )了格诺(🍺)西斯(Gnosis)的(de )(📬)攻(gōng )(✖)击，并在冲突事件后消失，但事件的真相(🐈)却因(yīn )(🍯)为米(🌲)尔奇亚的消失而不(👼)为人知。在事件后，启动原始索哈尔（后(👆)来人类(lèi )(🍉)制造(🏆)出了(le )十(🎁)二(🎆)具(jù )索哈尔(🐸)模拟体(tǐ )(🏗)，因此原(🈺)有的(🔝)索哈尔就被称(chēng )之为原始索哈(hā )尔）所需(🐼)的神之语言(📸)、原始索(suǒ )(🏒)哈尔的研(🦄)究成果、米尔奇(🍐)亚的U.M.N.座标等事物，都被封存(🏺)在Y资(🍏)料当(dāng )(🤙)中(zhōng )，而Y资(🤫)料又(yòu )被(🍆)封存在(🌄)百式观(😯)测用合成人(Relian)M.O.M.O.的意(yì )识内，然(rán )而这么做却引起了各方(🔘)势力对M.O.M.O.的争夺，因此星团联邦政(🤯)府(游(⏫)戏(🙎)中(zhōng )统治(zhì )各行星(👂)的政府(fǔ )，英文名Galaxy Federation)雇了一个名(🔷)叫(🏰)Ziggurat 8的生(shēng )化(huà )人(Cyborg)，以保护M.O.M.O.的安全。　(😇)　另一(yī )方面，在米尔奇亚(yà )(🤼)冲突事件结束后(hòu )(🦋)的(de )十几年，也就是(shì )大(dà )约(yuē )在游戏EPI开(kāi )始的(de )(🚱)时候，当时(🈶)最大的企业贝克达(dá )公(😌)司以(yǐ )对(duì )抗格诺西斯侵扰的(🤥)名义，进行(háng )(🥤)对格诺西斯(sī )用战斗兵器(qì )KOS-MOS的开发计划，但和当时多使(shǐ )用合(hé )成人(📌)(Relian)与生(🐂)化(😾)人(Cyborg)的情况所不同(💴)的(de )是，KOS-MOS是个纯粹的机(🚊)械制品。另一方面(miàn )(🤣)，在EPI开(😛)始(♑)时，参(cān )与KOS-MOS开(kāi )发计划的贝克达公(🏽)司第一开(kāi )发(🙃)局研(yán )究人员(yuán )卯(🚃)月(📘)紫(zǐ )苑，正乘着当时(🥪)载有还没正式启(qǐ )动的KOS-MOS的Woglinde号太(tài )空船进行旅途。但没想到其太(tài )空(kōng )船却(🏺)被冲著索(suǒ )哈尔(😙)而(👫)来的格(gé )(🖐)诺(nuò )西(🏗)斯所攻击，而KOS-MOS也在此时突然启动，卯(mǎo )(🍉)月紫苑因而被卷(juàn )入一(yī )(♌)连(lián )串和格诺(nuò )(㊙)西斯及索哈尔(ěr )有关(guān )的阴(🎿)谋，以及会改变人(rén )类命(🍮)运的事件当中……