继续延续上一季(🐽)的剧情，原来(🍩)穆德(🌰)受了(🕋)骗(😘)，及时发觉错误后和史考莉串通好来(🛤)骗政(🍖)府高层，以(yǐ )(🥩)潜入(rù )一(yī )个“作为一个普通FBI特别探(tàn )员不该进入的地方”搜集需要(👁)的(de )资料。本(běn )季发展越(🚥)来越(yuè )精彩，一些没有被(🍮)完(✖)全改(gǎi )造的混血外星人联合起(🤷)来抵抗殖民阴(yīn )谋。史(🔩)考(kǎo )莉被绑架时子宫被移除(chú )，但今(🎛)年却(què )出现(xiàn )了她的孩(hái )子(🔝)——艾蜜莉。今(jīn )年制作小组甚至(zhì )找(🎾)了(le )两位知(⛏)名科幻(huàn )小(xiǎo )说家操笔，客(kè )串(chuàn )(💠)写出(⛳)两集剧本。另外今年也(🤖)有一集(🌮)喜(👣)剧(jù )。整出X档案为了配合电(🛎)影(yǐng )(💍)的上映，加(🈸)入了一(🐛)些角(⛏)色及(jí )内容(róng )，“辛迪加(🚶)”组(📟)织(zhī )的阴谋越来越(💿)明显(🐡)，穆(🤔)德再(zài )一次接近事实的真相。穆德前(qián )女友(🐞)的出(chū )(🏃)现(🔞)也对穆德与史(shǐ )考莉(lì )间(🐖)的关系(xì )做出重(🚡)大(🌸)考验。该季结束于(yú )吸烟人烧毁(huǐ )了所有X档案(àn )卷宗。