拥有一头青色头发的(✒)男主角名字(zì )将叫作深井(jǐng )(🃏) 青(フカイ(🔱)·アオ，这名字在日(🆖)语中带(dài )有“深青(qīng )(🏴)”的(de )(🐮)意义），是一名13岁少年。青的父(😎)亲兰顿(dùn )·(🐿)萨斯顿(Renton Thurston、レ(🐖)ントン(📞)·サーストン)行踪不明，而母亲优(🤯)莱卡(Eureka、エウレカ)也在10年前(🔢)被美(měi )军带走(🎛)了。由于继承了母(mǔ )(📙)亲的(de )特殊(shū )基因，使得他(tā )(㊙)能够看见人眼所不能看(kàn )到的东(dōng )西，如粒(🤲)径为20nm大小的光(🥕)粒子，红外线、紫外线(👣)等等(děng )（但在外太空(kōng )这一(yī )特(tè )殊生理受(shòu )到限制）。小时(🌹)与(⛏)诊疗所里的老医生深井 敏夫(💯)一同(tóng )(🔈)生活，现正在Generation Blue（蓝色世代）中(zhōng )。　　(🔎)女(🌂)主角(🌱)的(👄)名字将是阿(💣)拉(🔥)塔·娜露，同样(yàng )(🎐)是(shì )13岁，是与青一(🚻)同成长(zhǎng )(🐂)的青梅竹马。娜露因为童年时(shí )的(de )事故(gù )而使拥有”ユタ”的力量(犹达，是日(rì )本(🈂)冲(chōng )绳以占卜为(👼)职业的灵媒(méi )师(shī )(💨)的(🈸)名(míng )称(🛃))的(🍾)眼睛醒(xǐng )觉。娜露有能够(🍉)听(tīng )懂珊(shān )瑚(🌒)岩心(xīn )声(⛎)的特异功(🍈)能(🕌)，这是因为珊瑚(🔝)岩的一部分(♈)在她体内成长，从某种程(🐼)度上(⛱)来说她和珊瑚岩存在(🎆)部分融(🔂)合，但正是因为这样，导致(zhì )她(tā )自小身体虚弱，需(📛)要把(bǎ )氧气放入在手上的(de )吸(xī )(⛄)氧(📒)器(qì )，现与父亲(💍)、妹(mèi )妹(🙇)及祖母一同生活(huó )中。　(😫)　本作的舞(wǔ )台也(yě )设定在(zài )冲绳的磐户岛(👉)上(🤖)，当时的磐户岛正进行著自(zì )治(zhì )权回复(⛹)运(yùn )动，但在(Ⓜ)某一(yī )天，在岛上(🚄)出(chū )现(🐎)的珊瑚(🤯)岩受(shòu )到了宿(📦)敌白细胞G-Monster的攻击(jī )，而为了(🐞)保(bǎo )护磐户(🌳)岛，男主角(🔉)青与人(😓)型IFO（Intelligent Flying Object）相遇，并与G-Monster战斗(dòu )的(🗒)故事就此展开(🤼)。