故事的舞台是互联网(✒)系统发达的都市「DEN CITY」。在(zài )那里有经(jīng )(🎗)由巨(jù )型企业「SOL技(jì )(🗼)术社(🥩)」通过高度的网(⏬)络技术构筑而(♑)成的被称为「LINK VRAINS」的(💆)VR空间。人们都在(zài )那(🛺)个(📞)VR空间中为(wéi )体验到(dào )全新的决斗而狂热。可是在(zài )「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑(💻)客(kè )行为(📙)的谜(✋)之(🐑)黑客(kè )集团「海(hǎi )诺因(👓)骑士团」。而他们的目标是(shì )将存在于互(🕙)联(⛳)网的某(👺)处的(🏯)“AI们的世界=电子(zǐ )界”毁灭。然而在世(💹)界受(shòu )到(🥊)这样的(🛎)威胁(🚗)时，有一(yī )名(míng )决斗者站了出来。而(ér )他的(de )名字正是(shì )「(🐩)Playmaker」。在那场传奇(qí )的战斗中，「Playmaker」使(📐)用(yòng )压倒性(xìng )的决(🐖)斗将(🖍)「海诺因骑士(shì )团」打倒，成功捕获(😳)了(👗)「SOL技术社(👚)」和「海(hǎi )(🧘)诺(nuò )因(yīn )骑士团(tuán )」都想要得(🚤)手(🚩)的迷之AI程序(xù )(⏺)。一度拯救了(le )世(🍯)界，然后(🈂)却突(tū )然消(🖱)声匿(nì )迹了(le )，而他的名字就在互(hù )联网的(🚓)世(shì )界中一(yī )瞬间(🏗)变得(dé )(🗒)声名(🐣)远(🌒)播，成为了(🍝)传说。而现在，作(zuò )为(♟)「Playmaker」的正体(😙)的某位高中(zhōng )生藤木游(🌲)作(zuò )，为了寻(xún )找过(🦄)去发生的某件事件的(🧔)真相(👎)，对再次在(zài )「VRAINS」出现(xiàn )的「海(hǎi )诺因(yīn )骑士团」展开了追(💽)击(💍)......  以此为契机，命运的齿(🐊)轮(😎)就此(🧖)转动……迷(mí )之AI的真身，「海诺因骑(🛍)士团(tuán )(🔦)」盯上「Link Vrains」(🐣)的目的，以(yǐ )及隐藏在(zài )游作过(📦)去的真相到底是———所有的(🈹)答案(🏚)，都在「Link Vrains」中(😓)