在旅行的(de )列(💠)车上(shàng )，美雪（(🥕)铃木杏(🧟) 饰(shì )）再次邂逅了金(🤘)田(🈁)一(yī )（松本润 饰），并(💍)追(zhuī )随于他。同伴用手中的DV记录着发生的一切。某(mǒu )(💯)夜，一个木偶团(🐡)长不幸被害。案发(fā )后，警探(📸)发现他原本在(🥅)车(🐞)厢(🍽)里的(de )尸体不翼而飞，于是引(yǐn )起(qǐ )了一(yī )(💣)阵骚乱(luàn )。探长决定在一家酒店暂时住下(xià )，找(zhǎo )寻(🐂)犯(👚)罪嫌(⏺)疑(👩)人(🧘)，金田一等(✖)人也一同(😉)前(🚤)往。后来，根(gēn )据(jù )案情，嫌疑人(🐈)被锁定在木偶团(tuán )体成员(yuán )(🖱)之中，探长想通过(guò )体重(chóng )以缩(🛌)小搜查(chá )范围。但是(shì )(👆)，一(🏗)个女成员的(de )意外死亡，却(🐸)让(ràng )金田一(yī )发(😼)现(🔮)了隐藏的(🦐)秘密，并由(⏭)此(🍗)揭(jiē )开(kāi )了(le )一(yī )桩尘封多年(nián )的旧(jiù )案真(zhēn )相……(🌽)
　　(➗)本片(piàn )根据天(🐁)树(shù )征丸(wán )的漫(🏽)画(huà )(🗺)改编，除上述特别版魔术列车(chē )杀人事件外，还包括以下6个事件，分别为幽灵(líng )客船(⏭)杀人(🔤)事件、法(💽)兰西(🥐)银币杀人事件、黑死蝶杀人(🈳)事件、速水(💁)玲香(xiāng )诱拐杀人事(🤥)件、魔术的森杀(shā )人事(shì )件和露西亚(🏐)人形杀人事件。